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已删除的短信在苹果手机上恢复的方式有多种，以下是一些建议的方法。
1、iTunes备份恢复：如果之前有使用iTunes备份过手机数据，那么可以通过iTunes备份恢复已删除的短信，具体步骤包括打开iTunes，然后找到“恢复备份”选项，选择最近的备份时间进行恢复。
2、iCloud备份恢复：如果使用了iCloud备份，可以登录iCloud官网，进入备份恢复页面进行恢复。
3、使用第三方软件恢复：市面上有一些第三方数据恢复软件，例如开心手机恢复大师等，可以通过这些软件扫描手机或iTunes备份文件来恢复已删除的短信。
4、直接从手机恢复：在手机中删除短信后，可能会短暂地保留在一个叫做“最近删除”的文件夹中，可以在短信应用内找到该文件夹，查看是否有误删的短信。
无论使用哪种方法，都应在发现短信被删除后尽快采取行动，因为随着时间的推移，数据可能被覆盖或损坏，导致无法恢复，第三方软件可能存在风险，使用时请谨慎选择并遵循相关操作指南，如果遇到困难，建议寻求专业人士的帮助。